MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Nostoc sp. PCC 7120 plasmid pCC7120epsilon

Total Repeats: 652

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003270	A	8	8	1540	1547	100 %	0 %	0 %	0 %	17227466
2	NC_003270	GGA	2	6	1566	1571	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	17227466
3	NC_003270	TCA	2	6	1576	1581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17227466
4	NC_003270	AGA	2	6	1584	1589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	17227466
5	NC_003270	GAC	2	6	1696	1701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17227466
6	NC_003270	CAA	2	6	1773	1778	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17227466
7	NC_003270	GT	3	6	1791	1796	0 %	50 %	50 %	0 %	17227466
8	NC_003270	CGG	2	6	1896	1901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17227466
9	NC_003270	GCA	2	6	1916	1921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17227466
10	NC_003270	G	6	6	1982	1987	0 %	0 %	100 %	0 %	17227466
11	NC_003270	CCAC	2	8	2003	2010	25 %	0 %	0 %	75 %	17227466
12	NC_003270	CACT	2	8	2051	2058	25 %	25 %	0 %	50 %	17227466
13	NC_003270	A	6	6	2074	2079	100 %	0 %	0 %	0 %	17227466
14	NC_003270	ATG	2	6	2132	2137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17227466
15	NC_003270	ACC	2	6	2156	2161	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17227466
16	NC_003270	AAG	2	6	2252	2257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	17227466
17	NC_003270	CAA	2	6	2281	2286	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17227466
18	NC_003270	ATT	2	6	2301	2306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	17227466
19	NC_003270	GGTCAC	2	12	2356	2367	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	17227466
20	NC_003270	GCG	3	9	2423	2431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17227466
21	NC_003270	GATT	2	8	2436	2443	25 %	50 %	25 %	0 %	17227466
22	NC_003270	GCG	2	6	2554	2559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17227466
23	NC_003270	CACCC	2	10	2592	2601	20 %	0 %	0 %	80 %	17227466
24	NC_003270	TTACC	2	10	2637	2646	20 %	40 %	0 %	40 %	17227466
25	NC_003270	CAA	2	6	2647	2652	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17227466
26	NC_003270	ACT	2	6	2697	2702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17227466
27	NC_003270	TGA	2	6	2709	2714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17227466
28	NC_003270	CAA	2	6	2716	2721	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17227466
29	NC_003270	AAC	2	6	2794	2799	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17227466
30	NC_003270	GGT	2	6	2860	2865	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17227466
31	NC_003270	CTG	2	6	2893	2898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17227466
32	NC_003270	TTC	2	6	2901	2906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17227466
33	NC_003270	CAA	2	6	3068	3073	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17227466
34	NC_003270	CAA	2	6	3115	3120	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17227466
35	NC_003270	GCG	2	6	3133	3138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17227466
36	NC_003270	CAG	2	6	3148	3153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17227466
37	NC_003270	CTT	2	6	3154	3159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17227466
38	NC_003270	ATGG	2	8	3164	3171	25 %	25 %	50 %	0 %	17227466
39	NC_003270	CAG	2	6	3184	3189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17227466
40	NC_003270	GAT	2	6	3202	3207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17227466
41	NC_003270	ATG	2	6	3462	3467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17227467
42	NC_003270	GCAACA	2	12	3484	3495	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	17227467
43	NC_003270	ACC	2	6	3516	3521	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17227467
44	NC_003270	CTG	2	6	3527	3532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17227467
45	NC_003270	CCA	2	6	3544	3549	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17227467
46	NC_003270	CTC	2	6	3581	3586	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	17227467
47	NC_003270	AAT	2	6	3605	3610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17227467
48	NC_003270	GTA	2	6	3616	3621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17227467
49	NC_003270	TCGT	2	8	3732	3739	0 %	50 %	25 %	25 %	17227467
50	NC_003270	TAA	2	6	3746	3751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17227467
51	NC_003270	AACT	2	8	3819	3826	50 %	25 %	0 %	25 %	17227467
52	NC_003270	CTC	2	6	4762	4767	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	17227468
53	NC_003270	ACTC	2	8	4800	4807	25 %	25 %	0 %	50 %	17227468
54	NC_003270	TTC	2	6	4813	4818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17227468
55	NC_003270	GTT	2	6	4965	4970	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17227468
56	NC_003270	CT	3	6	5057	5062	0 %	50 %	0 %	50 %	17227468
57	NC_003270	TGT	2	6	5068	5073	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17227468
58	NC_003270	CT	3	6	5081	5086	0 %	50 %	0 %	50 %	17227468
59	NC_003270	TGCT	2	8	5145	5152	0 %	50 %	25 %	25 %	17227468
60	NC_003270	GACATT	2	12	5275	5286	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	17227468
61	NC_003270	GTT	2	6	5301	5306	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17227468
62	NC_003270	ATT	2	6	5335	5340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	17227468
63	NC_003270	T	7	7	5339	5345	0 %	100 %	0 %	0 %	17227468
64	NC_003270	TCA	2	6	5357	5362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17227468
65	NC_003270	GTGG	2	8	5368	5375	0 %	25 %	75 %	0 %	17227468
66	NC_003270	TTG	2	6	5401	5406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17227468
67	NC_003270	GATG	2	8	5528	5535	25 %	25 %	50 %	0 %	17227468
68	NC_003270	AAT	2	6	5564	5569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17227468
69	NC_003270	TTC	2	6	5812	5817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17227468
70	NC_003270	TTG	2	6	5824	5829	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17227468
71	NC_003270	ATC	2	6	5879	5884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17227468
72	NC_003270	AC	3	6	5906	5911	50 %	0 %	0 %	50 %	17227468
73	NC_003270	GCG	2	6	6014	6019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17227468
74	NC_003270	CTTTGC	2	12	6114	6125	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	17227468
75	NC_003270	TCA	2	6	6260	6265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17227468
76	NC_003270	AGC	2	6	6288	6293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17227468
77	NC_003270	TGA	2	6	6305	6310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17227468
78	NC_003270	TAC	2	6	6325	6330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17227468
79	NC_003270	CAAG	2	8	6368	6375	50 %	0 %	25 %	25 %	17227468
80	NC_003270	TAA	2	6	6445	6450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17227468
81	NC_003270	TGT	2	6	6458	6463	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17227468
82	NC_003270	A	6	6	6544	6549	100 %	0 %	0 %	0 %	17227468
83	NC_003270	TTC	2	6	6568	6573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17227468
84	NC_003270	TTG	2	6	6707	6712	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17227468
85	NC_003270	AAT	2	6	6780	6785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17227468
86	NC_003270	TGCCA	2	10	6834	6843	20 %	20 %	20 %	40 %	17227468
87	NC_003270	GTA	2	6	6844	6849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17227468
88	NC_003270	CTC	2	6	6928	6933	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	17227468
89	NC_003270	GT	3	6	6957	6962	0 %	50 %	50 %	0 %	17227468
90	NC_003270	TTG	3	9	6973	6981	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17227468
91	NC_003270	TTC	2	6	6997	7002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17227468
92	NC_003270	CTA	2	6	7023	7028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17227468
93	NC_003270	CAA	2	6	7116	7121	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17227468
94	NC_003270	CCAG	2	8	7171	7178	25 %	0 %	25 %	50 %	17227468
95	NC_003270	A	6	6	7208	7213	100 %	0 %	0 %	0 %	17227468
96	NC_003270	AATG	2	8	7244	7251	50 %	25 %	25 %	0 %	17227468
97	NC_003270	CTG	2	6	7271	7276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17227468
98	NC_003270	GGCT	2	8	7311	7318	0 %	25 %	50 %	25 %	17227468
99	NC_003270	CAG	2	6	7345	7350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17227468
100	NC_003270	CTT	2	6	7419	7424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17227468
101	NC_003270	TTA	2	6	7439	7444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	17227468
102	NC_003270	CTGA	2	8	7463	7470	25 %	25 %	25 %	25 %	17227468
103	NC_003270	GCA	2	6	7499	7504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17227468
104	NC_003270	TGTGG	2	10	7649	7658	0 %	40 %	60 %	0 %	17227468
105	NC_003270	AGCA	2	8	7673	7680	50 %	0 %	25 %	25 %	17227468
106	NC_003270	TTC	2	6	7786	7791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17227468
107	NC_003270	AAC	2	6	7851	7856	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17227468
108	NC_003270	AT	3	6	7913	7918	50 %	50 %	0 %	0 %	17227468
109	NC_003270	AGG	2	6	7998	8003	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	17227468
110	NC_003270	TATT	2	8	8401	8408	25 %	75 %	0 %	0 %	17227469
111	NC_003270	TCT	2	6	8431	8436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17227469
112	NC_003270	AAG	2	6	8448	8453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	17227469
113	NC_003270	GTT	2	6	8476	8481	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17227469
114	NC_003270	TTC	2	6	8520	8525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17227469
115	NC_003270	TGTT	2	8	8551	8558	0 %	75 %	25 %	0 %	17227469
116	NC_003270	CTA	2	6	8977	8982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17227470
117	NC_003270	TGC	2	6	9076	9081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17227470
118	NC_003270	ACG	2	6	9084	9089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17227470
119	NC_003270	ACC	2	6	9102	9107	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17227470
120	NC_003270	TGAC	2	8	9114	9121	25 %	25 %	25 %	25 %	17227470
121	NC_003270	AGC	2	6	9163	9168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17227470
122	NC_003270	CCT	2	6	9216	9221	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	17227470
123	NC_003270	GAG	2	6	9231	9236	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	17227470
124	NC_003270	TTGA	2	8	9251	9258	25 %	50 %	25 %	0 %	17227470
125	NC_003270	TGG	2	6	9289	9294	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17227470
126	NC_003270	CAA	2	6	9306	9311	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17227470
127	NC_003270	ACG	2	6	9339	9344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17227470
128	NC_003270	CGC	2	6	9352	9357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17227470
129	NC_003270	AGC	2	6	9361	9366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17227470
130	NC_003270	AG	3	6	9586	9591	50 %	0 %	50 %	0 %	17227470
131	NC_003270	TGGTA	2	10	9608	9617	20 %	40 %	40 %	0 %	17227470
132	NC_003270	ATTC	2	8	9694	9701	25 %	50 %	0 %	25 %	17227470
133	NC_003270	TGCT	2	8	9724	9731	0 %	50 %	25 %	25 %	17227470
134	NC_003270	ATT	2	6	9734	9739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	17227470
135	NC_003270	TGA	2	6	9766	9771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17227470
136	NC_003270	CAA	2	6	9846	9851	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17227470
137	NC_003270	AAC	2	6	9940	9945	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17227471
138	NC_003270	TGA	2	6	9953	9958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17227471
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246	NC_003270	TGG	2	6	16629	16634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17227479
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249	NC_003270	TTC	2	6	16683	16688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17227479
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263	NC_003270	GGT	2	6	17143	17148	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17227480
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